Atlas in seiner normalen Gestalt.(Wader´s Skin)
Frank Fontaine alias Atlas
Wenn man am Anfang von Bioshock mit der Tauchkugel nach unten fährt hört man ein Gespräch mit, zwischen Atlas und einem gewissen Johnny, welcher von Atlas angewiesen wurde Jack, also den Spieler, zu empfangen. Johnny wird allerdings vor den Augen des Spielers von einem Splicer getötet. Atlas bittet Jack nun das Funkgerät an sich zu nehmen und führt den Spieler ab da in die Geschichte Raptures ein. Unter anderem erklärt er die Beziehung einer Little Sister zu ihrem Big Daddy, die Funktionsweise der Plasmide und die Gefahr der Splicer.
Er selbst stellt sich als normalen Menschen vor und will den Spieler unterstützen, damit beide sicher die Station verlassen können. Atlas weißt außerdem darauf hin, dass er eine Familie hat, die er mitnehmen will. Nach einigen Strapazen sieht es so aus als könnten alle gemeinsam mit einem U-Boot flüchten, doch dann greifen Splicer im Autrag von Andrew Ryan Atlas und das Boot, in dem sich seine Familie befindet, an, dabei findet diese den Tod.
Schließlich schickt Atlas den Spieler aus um Ryan zu töten, dieser erkennt, dass ihm alles aus den Händen gleitet und aktiviert den Selbstzerstörungsmechanismus Raptures. Im Gespräch mit Ryan und den vorhergegangenen Audiotagebüchern wird klar, dass Jack sein Sohn ist, welchen Atlas von Dr. Yi Suchong und Dr. Brigid Tenenbaum genetisch verändern ließ, damit dieser schneller wächst und jedem Befehl, der mit den Worten "Wärst du so freundlich" eingeleitet wird, folgen muss.
Diese Floskel tritt tatsächlich immer wieder im Spiel auf, sogar ganz am Anfang bei dem "Geschenk" von Jack's Eltern. Dieses war im übrigen eine Pistole damit er das Flugzeug in seine Gewalt bringen konnte.
Would you kindly not open until: 63° 2' N, 29° 55' W (dies sind die Koordinaten von Rapture) das heißt soviel wie: Wärst du so freundlich [das Paket] nicht zu öffnen, bis [du] Rapture (63° 2' N, 23° 55' W) [erreichst]?
Ein wichtiger Grund, weswegen sich Atlas diese Mühe gemacht hat, ist, dass Jack als Ryans Sohn soviel von dessen DNA hat, so das er jede Funktion Raptures nutzen kann, ohne den für die Bevölkerung getroffenen Einschränkungen zu unterliegen. Ein Beispiel ist die Benutzung der Tauchkugeln.
Nachdem Ryan tot ist, befiehlt Atlas dem Spieler den Selbstzerstörungsmechanismus abzuschalten, dabei werden alle Funktionen Raptures auf Atlas überschrieben. Wenn dies erledigt ist, offenbart sich Atlas als Frank Fontaine und versucht den Spieler mit Hilfe des Sicherheitssystems auszuschalten, dieser kann aber mit Hilfe einer geretteten Little Sister entkommen.
Im späteren Verlauf des Spiels wird klar, dass die Geschichte mit Atlas' Familie gelogen war, dass Jacks Vergangenheit ihm genetisch einprogrammiert wurde und Fontaine ihn dazu zwang das Flugzeug zu kidnappen um nach Rapture zu kommen. Der Grund dafür war einzig und allein Fontaines Ziel Ryan zu stürzen und die Stadt zu übernehmen um mit dem gesamten ADAM verschwinden zu können.