Jack est le seul survivant d'un crash aérien. L'avion en question s'est écrasé près d'un phare mystérieux, dans le quel il se réfugie. A peine entré à l’intérieur les portes se referment et il se retrouve dans le noir. Quand la lumière revient, il aperçoit une statue où est écrit "ni dieux ni rois,le pouvoir à l'homme". Jack emprunte des escaliers qui l’emmènent en profondeur où il trouve une bathysphère, qui le conduit dans la ville aquatique de Rapture où il découvrira de nombreuses vérités sur son identité.
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